2) толстом кишечнике (+)
3) полости рта
4) двенадцатиперстной кишке
Максимальная плотность нормальной микробиоты приходится на толстую кишку. В её просвете концентрация микроорганизмов обычно достигает 1010–1011 КОЕ/г содержимого, причём преобладают облигатные анаэробы: представители Bacteroidota, Bacillota (Firmicutes), Actinobacteriota и других таксонов. Высокая численность обусловлена длительным временем транзита, большим количеством субстратов для ферментации, низким окислительно-восстановительным потенциалом и всасыванием воды, повышающим плотность микробной массы.
В верхних отделах пищеварительного тракта микробная нагрузка значительно ниже. Её ограничивают кислота желудка, желчные кислоты, панкреатические ферменты, относительно быстрый пассаж содержимого и неблагоприятные условия для анаэробов. Толстокишечная микробиота участвует в синтезе короткоцепочечных жирных кислот, метаболизме компонентов пищи, поддержании слизистого барьера и колонизационной резистентности, то есть препятствует размножению потенциально патогенных микроорганизмов.
| Отдел пищеварительного тракта | Ориентировочная микробная нагрузка | Преобладающие особенности | Факторы, ограничивающие рост |
|---|---|---|---|
| Полость рта | Обычно 107–109 КОЕ/мл слюны; в зубном налёте выше | Разнообразная аэробная и анаэробная микробиота, выраженные биоплёнки | Смывание слюной, механическое очищение, антимикробные компоненты слюны |
| Желудок | Примерно 101–103 КОЕ/мл натощак | Небольшое количество кислотоустойчивых микроорганизмов | Кислый желудочный сок, протеолитические ферменты, моторика |
| Двенадцатиперстная кишка | Около 102–104 КОЕ/мл | Переходная микробиота, преимущественно факультативные анаэробы | Желчные кислоты, ферменты поджелудочной железы, быстрый пассаж |
| Тощая и подвздошная кишка | От 103–105 до 106–108 КОЕ/мл | Плотность постепенно увеличивается по направлению к илеоцекальной зоне | Перистальтика, желчь, относительно ограниченное количество доступных субстратов |
| Толстая кишка | Обычно 1010–1011 КОЕ/г содержимого | Доминирование облигатных анаэробов и высокая метаболическая активность | Основное ограничение — конкуренция внутри сложного микробного сообщества и иммунный контроль слизистой |
| Каловые массы | Высокая концентрация, отражающая преимущественно просветную микробиоту толстой кишки | Много анаэробных бактерий; состав зависит от питания, лекарств и заболеваний | Показатель не полностью отражает пристеночную и слизистую микробиоту |
Высокая численность бактерий в толстой кишке является физиологической и сама по себе не свидетельствует о дисбиозе или инфекции. Оценка микробиоты требует учитывать клинические симптомы, результаты посевов или молекулярных методов и наличие воспалительных признаков. При антибиотикотерапии особенно важно помнить о нарушении колонизационной резистентности и риске избыточного роста условно-патогенных микроорганизмов. Таким образом, толстая кишка представляет собой основной биотоп нормальной микробиоты пищеварительного тракта.