2) этамбутолу
3) фторхинолонам (+)
4) изиниозиду
Ген gyrA кодирует A-субъединицу ДНК-гиразы микобактерий туберкулёза — фермента, обеспечивающего суперспирализацию и репликацию ДНК. Фторхинолоны связываются с комплексом ДНК–ДНК-гираза и стабилизируют разрыв цепей ДНК, что блокирует репликацию и транскрипцию микобактерий. Поэтому аминокислотные замены в хинолон-резистентном детерминирующем участке (QRDR) гена gyrA снижают сродство мишени к препарату и формируют устойчивость.
Наиболее значимые мутации у Mycobacterium tuberculosis локализуются в кодонах 90, 91 и 94; типичными вариантами являются A90V, S91P и замены D94. Они могут обусловливать устойчивость к левофлоксацину, моксифлоксацину и другим фторхинолонам, хотя выраженность перекрёстной устойчивости зависит от конкретной мутации и препарата. Дополнительную роль могут играть изменения в gyrB, однако именно gyrA является основным генетическим маркером устойчивости к фторхинолонам.
Молекулярное выявление мутаций в gyrA и gyrB позволяет быстро предположить устойчивость и своевременно скорректировать режим лечения лекарственно-устойчивого туберкулёза. Результат генотипического теста оценивают совместно с фенотипическим исследованием лекарственной чувствительности, поскольку отдельные редкие мутации могут иметь неопределённое клиническое значение, а отсутствие обнаруженной мутации не исключает другие механизмы резистентности.
| Антимикобактериальный препарат или класс | Основная генетическая мишень устойчивости | Ключевой диагностический ориентир |
|---|---|---|
| Фторхинолоны | gyrA, реже gyrB | Мутации в QRDR, особенно в кодонах 90, 91 и 94 gyrA |
| Аминогликозиды | rrs, eis, реже tlyA | Изменение мишени рибосомы или усиление ферментативной модификации препарата |
| Этамбутол | embB, реже другие гены кластера emb | Нарушение синтеза арабиногалактана клеточной стенки |
| Изониазид | katG, inhA и регуляторные участки | Нарушение активации пролекарства или изменение мишени синтеза миколовых кислот |
| Рифампицин | rpoB | Мутации в области определения устойчивости к рифампицину; маркер возможной множественной лекарственной устойчивости |
| Пиразинамид | pncA, реже rpsA и другие участки | Нарушение превращения пиразинамида в активную пиразиновую кислоту или изменения её мишени |
| Циклосерин | alr, ddl и другие гены метаболизма клеточной стенки | Изменение синтеза компонентов пептидогликана; генотипическая интерпретация сложнее |
Таким образом, обнаружение мутации в gyrA прежде всего указывает на лекарственную устойчивость микобактерий к фторхинолонам. Это имеет принципиальное значение для выбора эффективного режима терапии и исключения функционально неактивного препарата. Окончательное решение о чувствительности принимают с учётом конкретного варианта мутации, минимальной подавляющей концентрации и результатов комплексного тестирования.