2) микро РНК
3) рибосомные РНК (+)
4) малоядерные РНК
Рибосомные РНК относятся к некодирующим РНК, поскольку не служат матрицей для синтеза белка, однако в стандартной функциональной классификации их не включают в группу малых некодирующих РНК. рРНК являются структурно-каталитическим компонентом рибосом: они формируют каркас рибосомных субъединиц и участвуют в образовании пептидной связи в рибосоме. Их транскрипты часто синтезируются в виде предшественников и затем подвергаются процессингу и химическим модификациям.
К малым некодирующим РНК относят преимущественно молекулы, регулирующие экспрессию генов, сплайсинг, процессинг и модификацию других РНК. МикроРНК связываются с комплементарными участками матричных РНК и подавляют трансляцию либо ускоряют их деградацию; малоядерные РНК входят в состав сплайсосомы; гидовые РНК направляют РНК-белковые комплексы к определённым нуклеотидным последовательностям. Небольшой размер отдельных рРНК, например 5S рРНК, не меняет их функциональной принадлежности к рибосомным, а не к регуляторным или процессинговым малым РНК.
| Тип РНК | Ориентировочный размер | Основная функция | Ключевой клеточный процесс |
|---|---|---|---|
| МикроРНК (miRNA) | Около 18–24 нуклеотидов | Посттранскрипционная регуляция экспрессии генов | Подавление трансляции и деградация мРНК через комплекс RISC |
| Малоядерные РНК (snRNA) | Примерно 100–300 нуклеотидов | Формирование малых ядерных рибонуклеопротеинов | Распознавание границ интронов и сплайсинг пре-мРНК |
| Гидовые РНК | Варьирует; обычно малая или средняя длина | Направление ферментативного комплекса к комплементарной мишени | Процессинг, модификация или редактирование РНК |
| Малые ядрышковые РНК (snoRNA) | Около 60–300 нуклеотидов | Специфическое узнавание участков рРНК | Метилирование и псевдоуридилирование рРНК при её созревании |
| Рибосомные РНК (рРНК) | От малых 5S до крупных 18S, 28S и других форм | Структурная и каталитическая основа рибосомы | Сборка рибосом и трансляция мРНК |
| Длинные некодирующие РНК (lncRNA) | Более 200 нуклеотидов | Регуляция транскрипции, хроматина и стабильности РНК | Эпигенетическая и посттранскрипционная регуляция |
Таким образом, признак некодирующая не является достаточным для отнесения РНК к малым некодирующим РНК. При классификации учитывают размер, клеточную локализацию, механизм действия и биологическую функцию молекулы. рРНК участвуют непосредственно в реализации трансляции, тогда как большинство малых некодирующих РНК регулируют созревание или активность других РНК. Поэтому рибосомные РНК являются правильным исключением в данной классификации.