2) массовое параллельное секвенирование (MPS)
3) хэтчинг (hatching)
4) кариомэппинг (Karyomap gene chip) (+)
Верный ответ — кариомэппинг с использованием SNP-микроматрицы Karyomap. Метод основан на одновременном анализе большого числа однонуклеотидных полиморфизмов по всему геному эмбриона. По распределению аллелей выявляют анеуплоидии и другие изменения числа копий хромосом, а также устанавливают, какой родительский гаплотип унаследован эмбрионом в области гена, связанного с моногенным заболеванием.
Для диагностики моногенной патологии обычно исследуют ДНК будущих родителей и, при необходимости, больного родственника или ранее поражённого ребёнка. На основании информативных SNP формируются гаплотипы, сцепленные с патогенным вариантом; после биопсии трофэктодермы эмбриона определяется наличие или отсутствие соответствующего гаплотипа. Таким образом, Karyomap позволяет в рамках одного исследования сочетать преимплантационное генетическое тестирование на моногенное заболевание (PGT-M) и скрининг хромосомного набора (PGT-A).
Мультиплексная ПЦР преимущественно предназначена для амплификации нескольких конкретных участков ДНК и не обеспечивает полноценной оценки всего хромосомного набора. Массовое параллельное секвенирование может применяться для PGT-M и PGT-A, однако в формулировке данного вопроса именно SNP-микрочиповая технология Karyomap рассматривается как метод, специально объединяющий анализ наследования моногенной мутации и хромосомных нарушений. Хэтчинг является вспомогательной эмбриологической процедурой, при которой нарушают целостность zona pellucida, и диагностическим методом не считается.
| Подход | Основной принцип | Что выявляет | Роль при ПГТ |
|---|---|---|---|
| Karyomap, кариомэппинг | Генотипирование множества SNP с построением родительских и эмбриональных гаплотипов | Анеуплоидии, ряд изменений числа копий, наследование гаплотипа, связанного с моногенным заболеванием | Одновременное проведение PGT-M и PGT-A |
| Мультиплексная ПЦР | Параллельная амплификация нескольких заданных локусов | Конкретные известные варианты или участки генов | Целевая диагностика; ограниченные возможности для анализа всего генома |
| Массовое параллельное секвенирование | Параллельное чтение большого числа фрагментов ДНК | Нуклеотидные варианты, небольшие инделы, а при специальной настройке — анеуплоидии и CNV | Используется для PGT-M и PGT-A, но требует соответствующей панели и биоинформатического анализа |
| Хэтчинг | Механическое, химическое или лазерное истончение/вскрытие zona pellucida | Не является генетическим исследованием | Вспомогательная процедура для облегчения биопсии или имплантации |
| Прямое выявление патогенного варианта | Анализ самой мутации методом ПЦР или секвенирования | Известный нуклеотидный вариант в конкретном гене | Информативно при достаточном количестве ДНК; может дополнять гаплотипирование |
| Ключевое ограничение Karyomap | Зависимость от информативности SNP и корректного установления фазы аллелей | Не все варианты определяются напрямую; возможны проблемы при рекомбинации или отсутствии информативного родственника | Требуется предварительная семейная валидация теста и подтверждение результата |
Кариомэппинг особенно полезен в семьях с известным моногенным заболеванием и одновременно повышенным риском хромосомных нарушений. Для достоверной интерпретации необходимо учитывать возможную рекомбинацию в области локуса, мозаицизм эмбриона и ограничения биопсии небольшого числа клеток. Результат ПГТ не заменяет пренатальную диагностику, поэтому при наступлении беременности рекомендуется подтверждение методом биопсии хориона или амниоцентеза. При выявлении сложных структурных перестроек или вариантов, не охватываемых SNP-анализом, применяют дополнительные молекулярно-генетические методы.