2) хромосомой
3) локусом
4) геном (+)
Геном — это полный набор генетического материала организма или клетки, представленный совокупностью последовательностей ДНК ядерного и, при необходимости, органелльного происхождения. В классическом понимании он соответствует гаплоидному набору хромосом, однако в современной геномике к геному относят не только белок-кодирующие участки, но и регуляторные, интронные, межгенные последовательности, а также гены функциональных некодирующих РНК.
Геном способен содержать сцепленные и частично перекрывающиеся последовательности, из которых образуются различные функциональные продукты: белки, изоформы белков, микроРНК, длинные некодирующие РНК и антисмысловые транскрипты. Перекрывание может возникать за счет альтернативных рамок считывания, альтернативного сплайсинга или использования противоположных цепей ДНК. Поэтому совокупность таких последовательностей характеризует именно общий генетический план организма, а не отдельный участок или вариант последовательности.
Аллель представляет собой конкретный вариант одного гена или другого участка ДНК, локус — его определенное положение в хромосоме, а хромосома — структурно организованную молекулу ДНК с комплексом белков. Эти понятия являются уровнями организации генетического материала внутри генома и не охватывают его целиком. В клинической практике разграничение терминов необходимо при интерпретации результатов секвенирования, описании вариантов и установлении их связи с наследственным заболеванием.
| Термин | Что обозначает | Основной диагностический контекст |
|---|---|---|
| Геном | Полный набор генетических последовательностей организма; включает кодирующие и некодирующие области | Полногеномное секвенирование, анализ структурных вариантов и общей генетической архитектуры |
| Хромосома | Компактно организованная молекула ДНК, содержащая множество генов и регуляторных элементов | Кариотипирование, выявление анеуплоидий, крупных перестроек и транслокаций |
| Локус | Физическое или цитогенетическое положение гена либо другого участка ДНК | Картирование варианта, описание положения мутации и анализ сцепления признаков |
| Аллель | Одна из альтернативных форм последовательности, расположенных в одном локусе | Определение гетерозиготности, патогенного варианта и характера наследования |
| Ген | Функциональная единица наследственности, кодирующая белок или функциональную РНК с регулирующими элементами | Молекулярно-генетическая диагностика моногенных заболеваний и оценка экспрессии |
В генетической диагностике исследование генома позволяет одновременно оценивать варианты в кодирующих, регуляторных и межгенных областях. Выявленный вариант не считается патогенным только по факту присутствия: его классифицируют с учетом частоты в популяции, функциональных данных, семейного анализа и соответствия фенотипу. При этом уровень генома используется для комплексной оценки наследственного риска, тогда как конкретный диагноз часто определяется вариантом в определенном гене и локусе.