2) рибосомальные РНК
3) транспортные РНК
4) внеклеточные кДНК
Отмеченный вариант соответствует принципу антисмысловой терапии: антисмысловая РНК содержит последовательность, комплементарную мРНК онкогена, и связывается с ней по правилам комплементарности. Образование РНК–РНК-дуплекса препятствует присоединению рибосомы, нарушает трансляцию и может изменять процессинг или стабильность целевой мРНК. В современной терминологии чаще используют понятия антисмысловая РНК и антисмысловые олигонуклеотиды ; к последним относятся, в частности, химически модифицированные препараты и конструкции типа gapmer.
Механизм подавления зависит от молекулярной конструкции. Стерически блокирующие антисмысловые последовательности непосредственно выключают трансляцию или влияют на сплайсинг, а ДНК-содержащие gapmer-олигонуклеотиды после гибридизации с мРНК привлекают РНКазу H1, вызывающую разрушение РНК-компонента гибрида. При использовании коротких двуцепочечных РНК возможна активация РНК-интерференции: антисмысловая цепь входит в состав комплекса RISC, который распознаёт и расщепляет комплементарную мРНК.
Такой подход направлен на снижение экспрессии конкретного онкогена, например при патологической активации генов MYC, RAS, BCL2 или других регуляторов пролиферации и апоптоза. Эффективность определяется точностью комплементарности, доступностью мишени в клетке, уровнем экспрессии онкогена и способностью препарата проникать в нужную ткань.
| Молекула или подход | Основная функция | Возможность блокирования онкогена | Ключевой механизм |
|---|---|---|---|
| Антисмысловая РНК | Комплементарное связывание с мРНК-мишенью | Да | Блокада трансляции, нарушение сплайсинга или снижение стабильности мРНК |
| Антисмысловой олигонуклеотид типа gapmer | Специфическое распознавание мРНК | Да | Формирование ДНК–РНК-гибрида и деградация мРНК РНКазой H1 |
| Малая интерферирующая РНК | Посттранскрипционное подавление экспрессии | Да | Включение направляющей цепи в комплекс RISC и расщепление комплементарной мРНК |
| Рибосомальная РНК | Структурная и каталитическая основа рибосомы | Нет, сама по себе не является адресным блокатором | Участие в сборке рибосомы и образовании пептидной связи |
| Транспортная РНК | Доставка аминокислот к рибосоме | Нет | Распознавание кодонов мРНК антикодоном и участие в трансляции |
| Внеклеточная кДНК | ДНК-копия зрелой мРНК, используемая преимущественно в молекулярной генетике и векторах | Нет как прямой терапевтический блокатор | Не обеспечивает специфического разрушения мРНК; может служить матрицей для экспрессии белка или синтеза РНК после доставки в клетку |
Антисмысловая терапия регулирует экспрессию уже активного гена и не требует непосредственного исправления мутации в ДНК. Для клинического применения важны химическая стабилизация молекулы, внутриклеточная доставка и снижение неспецифического связывания. Потенциальными ограничениями являются эффекты вне мишени, активация врождённого иммунитета и недостаточное накопление препарата в опухоли. Поэтому результат лечения оценивают не только по клиническому ответу, но и по снижению уровня транскрипта или белка-мишени.