2) транскриптом (+)
3) экзоном
4) геном
Отмеченный вариант подразумевает транскрипт — молекулу РНК, синтезированную на матрице участка ДНК. В строгой молекулярно-генетической терминологии транскриптом — это совокупность всех РНК-транскриптов клетки, ткани или организма в определённых условиях, тогда как отдельная молекула называется РНК-транскриптом. В учебных тестах эти понятия иногда смешиваются, поэтому приведённый ответ следует трактовать как обозначение продукта транскрипции.
Транскрипция осуществляется РНК-полимеразой: фермент распознаёт промотор, использует одну цепь ДНК в качестве матрицы и синтезирует комплементарную РНК в направлении 5′→3′. У эукариот первичный транскрипт пре-мРНК обычно подвергается процессингу — кэпированию, полиаденилированию и сплайсингу; в результате формируется зрелая информационная РНК. В процессе транскрипции также образуются некодирующие РНК, включая рРНК, тРНК, микроРНК и длинные некодирующие РНК.
Другие обозначения относятся к иным уровням организации генетической информации. Метаболит является продуктом обмена веществ, экзон — участком гена, сохраняющимся в зрелом РНК-транскрипте после сплайсинга, а геном представляет собой совокупность генетического материала организма. Такое разграничение принципиально при исследовании экспрессии генов, выявлении альтернативного сплайсинга и интерпретации результатов РНК-секвенирования.
| Термин | Определение | Связь с транскрипцией |
|---|---|---|
| РНК-транскрипт | Отдельная молекула РНК, синтезированная на матрице ДНК | Непосредственный продукт работы РНК-полимеразы |
| Транскриптом | Совокупность всех РНК, присутствующих в клетке или ткани при определённых условиях | Характеризует профиль экспрессии генов; не обозначает одну молекулу в строгой терминологии |
| Первичный транскрипт, или пре-мРНК | Незрелая РНК, содержащая экзоны и интроны | Образуется непосредственно после транскрипции гена эукариот |
| Зрелая мРНК | Процессированная информационная РНК с кэпом, поли-А-хвостом и удалёнными интронами | Переносит кодирующую информацию к рибосомам |
| Экзон | Участок гена, сохраняющийся в зрелой РНК после сплайсинга | Является частью транскрипта, но не самостоятельным продуктом транскрипции |
| Геном | Полный объём генетического материала организма или клетки | Содержит ДНК-последовательности, служащие матрицами для синтеза РНК |
| Метаболит | Промежуточный или конечный продукт биохимического обмена | Не является молекулярным продуктом транскрипции |
В лабораторной генетике наличие и количество конкретных РНК-транскриптов оценивают методами ОТ-ПЦР, количественной ПЦР и RNA-seq. Изменение транскрипционного профиля может отражать активацию онкогенов, нарушение дифференцировки или тканеспецифическую экспрессию. Анализ транскриптома позволяет одновременно исследовать экспрессию множества генов и выявлять альтернативные изоформы РНК. Поэтому важно различать отдельный транскрипт и совокупность РНК, формирующую транскриптом.