2) АГГ
3) АУУ
4) АУГ (+)
Кодон АУГ является основным инициирующим кодоном трансляции и кодирует метионин. Его распознаёт инициаторная тРНК с антикодоном УАЦ; после спаривания кодона и антикодона формируется стартовый комплекс, задающий рамку считывания мРНК. У эукариот малая субъединица рибосомы сканирует мРНК от 5′-конца и обычно выбирает АУГ в благоприятном контексте Козак, после чего присоединяется большая субъединица и начинается синтез полипептида.
При инициации в эукариотическую цепь включается метионин, а у бактерий — формилметионин, поскольку используется модифицированный инициаторный тРНК-комплекс. В прокариотах положение стартового АУГ определяется, в частности, взаимодействием последовательности Шайна—Дальгарно с рибосомой. Следует отличать стартовый АУГ от последующих кодонов АУГ внутри открытой рамки считывания: в процессе элонгации они также кодируют метионин, но уже не выполняют функцию сигнала начала трансляции.
Остальные представленные триплеты не являются кодоном метионина: АГУ кодирует серин, АГГ — аргинин, АУУ — изолейцин. Тем самым правильный выбор определяется соответствием триплета генетическому коду и его ключевой роли в инициации трансляции.
| Триплет мРНК | Аминокислота или функция | Роль в трансляции |
|---|---|---|
| АУГ | Метионин | Основной кодон инициации; определяет начало открытой рамки считывания |
| АГУ | Серин | Кодон элонгации, не служит стандартным сигналом начала трансляции |
| АГГ | Аргинин | Кодон включения аргинина в растущую полипептидную цепь |
| АУУ | Изолейцин | Кодон элонгации; не кодирует метионин |
| УАА, УАГ, УГА | Стоп-кодоны | Не кодируют аминокислоту; распознаются факторами терминации |
| ГУГ, реже УУГ у бактерий | Альтернативные инициирующие кодоны | Могут запускать трансляцию в прокариотах, но при инициации также присоединяют формилметионин |
Правильность выбора стартового кодона оценивают не только по его последовательности, но и по контексту мРНК и положению относительно регуляторных участков. Мутации в области АУГ или в последовательности Козак/Шайна—Дальгарно могут нарушать инициацию и снижать синтез белка. В лабораторной генетике такие варианты рассматривают как потенциальные изменения стартового кодона и оценивают с учётом данных транскриптомного, биохимического и функционального анализа. После инициации рибосома последовательно считывает кодоны мРНК в направлении 5′→3′ до достижения стоп-сигнала.