1. болезненное введение лекарственного препарата;
2. выраженная аллергическая реакция;
3. не все лекарственные препараты могут быть использованы для лекарственного электрофореза;+
4. неизвестна полярность многих лекарств;
5. трудность определения точного количества введенного лекарственного вещества.+