1) определение значений частоты встречаемости индивидуальных аллельных состояний (генотипов) определенных полиморфных локусов
2) установление профилей структурного полиморфизма (аллельных профилей, генотипов, гаплотипов) исследуемых ДНК с целью установления генетической идентичности объектов (+)
3) установление генных мутаций исследуемых ДНК
4) установление фенотипических признаков объектов