↑ Вверх ↓ Вниз

Механизм инжекции пцр-продуктов в капилляры генетического анализатора (ответ на вопрос)

МЕХАНИЗМ ИНЖЕКЦИИ ПЦР-ПРОДУКТОВ В КАПИЛЛЯРЫ ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗАТОРА
1) пневматический
2) гидродинамический
3) электрокинетический (+)
4) гидростатический

В генетических анализаторах продукты ПЦР вводятся в разделительный капилляр преимущественно электрокинетически: между электродом в пробе и электродом на выходе капилляра прикладывается высокое напряжение, создающее электрическое поле. ДНК имеет отрицательный заряд благодаря фосфатным группам, поэтому ее молекулы направленно мигрируют к положительно заряженному электроду и перемещаются через капиллярную инъекционную зону. Кратковременная подача напряжения обеспечивает дозированный ввод флуоресцентно меченных ампликонов или фрагментов, полученных при секвенировании.

После инжекции фрагменты разделяются в капилляре, заполненном полимерным электролитом, по их электрофоретической подвижности, которая главным образом зависит от длины молекул. На процесс также влияет электроосмотический поток — движение раствора относительно заряженной стенки капилляра, однако непосредственное привнесение ДНК в капилляр определяется действием электрического поля на заряженные молекулы, то есть электрокинетическим механизмом. Поэтому пневматическое, гидродинамическое или гидростатическое введение не является стандартным механизмом инжекции в классических системах капиллярного генетического анализа.

Объем и состав вводимой пробы зависят от напряжения и продолжительности инжекции, концентрации ДНК, ионной силы и электропроводности раствора. Избыточное содержание солей может изменять распределение электрического поля и снижать эффективность ввода, а слишком высокая концентрация ампликонов приводит к перегрузке сигнала и ухудшению разделения. Эти особенности имеют значение при интерпретации электрофореграмм, в том числе при анализе ДНК-профилей в судебно-генетических исследованиях.

МеханизмДвижущая силаЧто перемещается в капиллярТипичное применениеОсновные факторы, влияющие на ввод
ЭлектрокинетическийЭлектрическое поле и разность потенциаловЗаряженные молекулы ДНК, преимущественно анионыСтандартная инжекция в капиллярных генетических анализаторахНапряжение, время инжекции, концентрация ДНК, ионная сила и проводимость образца
ГидродинамическийПерепад давления между концами капилляраРаствор вместе с содержащимися в нем аналитамиНекоторые системы капиллярного электрофореза и автоматические анализаторыДавление, время подачи, вязкость и гидродинамическое сопротивление
ГидростатическийРазность уровней жидкости в резервуарахРаствор под действием силы тяжестиСпециальные или экспериментальные схемы вводаВысота столбов жидкости, плотность и вязкость раствора
ПневматическийДавление газа на поверхность образцаПроба, вытесняемая газом в каналНе является типичным механизмом ввода ДНК в стандартный генетический анализаторДавление газа, герметичность системы, объем вытеснения
Электроосмотический потокДвижение жидкой фазы вдоль заряженной стенки капилляраРаствор в целом, а не только молекулы ДНКВлияет на скорость и профиль миграции при капиллярном электрофорезеМатериал капилляра, pH, ионный состав буфера и поверхностный заряд
Электрофоретическая миграция ДНКСила, действующая на отрицательно заряженный фосфатный остов ДНКАмпликоны и другие фрагменты нуклеиновых кислотФормирует направленное перемещение и последующее разделение фрагментовРазмер фрагмента, заряд, напряженность поля и свойства полимерной матрицы

Электрокинетическая инжекция обеспечивает совместимость ввода с последующим капиллярным электрофорезом и позволяет получать воспроизводимые флуоресцентные профили. В судебной генетике это важно для корректного определения аллелей STR-маркеров и оценки качества ДНК-профиля. Нарушения режима инжекции проявляются изменением интенсивности пиков, дисбалансом аллелей и появлением артефактов электрофореграммы. Таким образом, правильный ответ основан на заряде молекул ДНК и их направленном движении в электрическом поле.Учебный курс: тесты с ответами для судебного эксперта.

Поделитесь с коллегами ссылкой на наш сайт