2) длиннее; одну повторяющуюся единицу
3) короче; одну повторяющуюся единицу (+)
4) короче; две повторяющиеся единицы
В судебно-генетическом исследовании статтером называют артефакт амплификации при ПЦР-типировании STR-маркеров (коротких тандемных повторов). Он возникает из-за проскальзывания ДНК-полимеразы или неправильного спаривания матричной и вновь синтезированной цепей в области повторяющихся последовательностей. Наиболее типичный продукт такого сбоя содержит на одну повторяющуюся единицу меньше, чем исходный, истинный аллель, поэтому правильным является вариант 3.
В электрофореграмме статтер обычно определяется как небольшой дополнительный пик непосредственно перед основным пиком аллеля, то есть в более короткой позиции. Для тетрануклеотидных STR-маркеров это чаще всего расстояние, соответствующее четырём парам нуклеотидов. Интенсивность статтер-пика значительно ниже интенсивности основного аллеля и зависит от локуса, длины аллеля, структуры повторов, состава праймеров и условий ПЦР.
От истинного аллеля артефакт отличают по его предсказуемому расположению, низкой относительной высоте или площади и соответствию валидированному для конкретной системы уровню статтера. Это особенно важно при анализе смешанных образцов, где статтер может имитировать слабый аллель второго участника. В таких случаях применяют пороги статтера, аналитические и стохастические пороги, а также программные модели вероятностного генотипирования.
| Признак | Истинный аллель | Статтер-артефакт |
|---|---|---|
| Генетическая природа | Реальный вариант STR-локуса, присутствующий в исследуемой ДНК | Продукт ошибки ПЦР, не являющийся самостоятельным аллелем генома |
| Размер фрагмента | Соответствует фактическому числу тандемных повторов | Обычно короче основного аллеля на одну повторяющуюся единицу |
| Положение на электрофореграмме | Формирует основной аллельный пик | Располагается непосредственно перед соответствующим основным пиком |
| Интенсивность сигнала | Как правило, выше и соответствует амплифицированной аллельной копии | Обычно значительно ниже; оценивается относительно высоты или площади родительского пика |
| Воспроизводимость | Стабильно выявляется при повторном исследовании образца | Возникает с характерной для локуса частотой и может изменяться при условиях амплификации |
| Механизм формирования | Наследуемая вариация числа повторов | Проскальзывание полимеразы и образование петли в области тандемных повторов |
| Значение при интерпретации | Учитывается при установлении генотипа и сравнении ДНК-профилей | Не должен автоматически интерпретироваться как аллель; оценивается по порогам и правилам валидации |
Статтер является одним из ключевых источников ошибок при интерпретации STR-профилей, особенно в низкокопийных и смешанных образцах. Для каждого набора маркеров устанавливают локус-специфические диапазоны допустимого статтера. Редкие варианты артефактов, включая продукты с потерей двух повторов или увеличением длины, возможны, но классическим и наиболее распространённым считается продукт, укороченный на одну повторяющуюся единицу. Корректное распознавание этого феномена повышает достоверность идентификационных выводов судебно-генетической экспертизы.