2) синтезирует короткий фрагмент РНК, называемый праймером, комплементарный одноцепочечной матрице ДНК (+)
3) разделяет цепи двухцепочечной ДНК на одинарные
4) катализирует полимеризацию дезоксирибонуклеотидов на матрице ДНК по принципу комплементарности
Верным является положение о том, что ДНК-праймаза вируса простого герпеса синтезирует короткий РНК-праймер на одноцепочечном участке вирусной ДНК. Праймер комплементарен матричной цепи и предоставляет свободную 3′-ОН-группу, необходимую для последующего присоединения дезоксирибонуклеотидов вирусной ДНК-полимеразой. Самостоятельно праймаза не осуществляет синтез ДНК: она выполняет начальный этап репликации, после чего цепь удлиняется ДНК-полимеразой.
У HSV праймазная активность связана с белком UL52, входящим в вирусный комплекс геликаза–праймаза вместе с геликазой UL5 и вспомогательным белком UL8. После расплетания двойной спирали UL5 вирусная праймаза использует открывшуюся одноцепочечную ДНК как матрицу, а образовавшийся РНК-праймер запускает синтез дочерней цепи. Изменение сверхспиральности с внесением одноцепочечных разрывов характерно для топоизомераз, разделение цепей — для геликаз, а полимеризация дезоксирибонуклеотидов — для ДНК-полимеразы.
Функциональная взаимосвязь белков, участвующих в репликации генома HSV, представлена ниже.
| Компонент | Основная функция | Непосредственный результат |
|---|---|---|
| UL52, праймаза | Синтез короткого РНК-праймера на одноцепочечной матрице ДНК | Формирование стартовой 3′-ОН-группы для синтеза ДНК |
| UL5, геликаза | АТФ-зависимое расплетание двойной спирали ДНК | Образование одноцепочечных участков, доступных для праймазы |
| UL8, вспомогательный белок | Стабилизация и координация работы комплекса геликаза–праймаза | Согласованное продвижение репликационной вилки |
| UL30, вирусная ДНК-полимераза | Комплементарное присоединение дезоксирибонуклеотидов к праймеру | Удлинение и формирование дочерней цепи ДНК |
| UL42, фактор процессивности | Удержание ДНК-полимеразы на матрице | Повышение эффективности непрерывного синтеза ДНК |
| Топоизомеразы клетки-хозяина | Временное разрезание и воссоединение цепей ДНК для снятия топологического напряжения | Изменение степени сверхспиральности, но не образование РНК-праймера |
Репликация HSV происходит в ядре инфицированной клетки и требует последовательной работы вирусных и клеточных ферментов. В лабораторной диагностике инфекцию обычно подтверждают обнаружением ДНК HSV-1 или HSV-2 методом ПЦР в материале из очага поражения, а не оценкой активности праймазы. Клинически применяемые нуклеозидные аналоги, включая ацикловир, после активации преимущественно ингибируют вирусную ДНК-полимеразу и вызывают преждевременное прекращение синтеза цепи. Поэтому праймаза является обязательным компонентом репликационного механизма, но не основным установленным мишеневым ферментом стандартной противогерпетической терапии.