2) одноцепочечную сегментированную РНК
3) двуцепочечную линейную РНК
4) одноцепочечную линейную РНК (+)
Вирус краснухи (Rubivirus rubellae, семейство Matonaviridae; ранее относился к Togaviridae) содержит несегментированный линейный одноцепочечный РНК-геном положительной полярности. Знак + означает, что геномная РНК функционально подобна матричной РНК клетки и после проникновения вируса в цитоплазму может непосредственно использоваться рибосомами для синтеза вирусных белков. Геном включает участки, кодирующие неструктурные белки, необходимые для репликации, и структурные белки капсида и оболочки.
Репликация происходит в цитоплазме через промежуточную отрицательную цепь, синтезируемую вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой. В отличие от вирусов с сегментированным геномом, у вируса краснухи отсутствуют отдельные геномные фрагменты, поэтому для него нехарактерны механизмы генетической реассортации, типичные, например, для вируса гриппа. Наличие РНК положительной полярности также определяет применение методов амплификации РНК, прежде всего обратной транскрипции с последующей ПЦР, для лабораторного подтверждения инфекции.
| Вирус | Семейство | Тип генома | Ключевое диагностическое или биологическое значение |
|---|---|---|---|
| Вирус краснухи | Matonaviridae | Линейная несегментированная одноцепочечная РНК (+) | Геномная РНК может непосредственно транслироваться; подтверждение — ОТ-ПЦР и серологические тесты |
| Вирус гриппа A | Orthomyxoviridae | Одноцепочечная РНК (−), 8 сегментов | Сегментированность обеспечивает возможность реассортации и антигенного шифта |
| Вирус кори | Paramyxoviridae | Линейная несегментированная одноцепочечная РНК (−) | Геном не функционирует как мРНК; необходима вирусная РНК-полимераза в составе вириона |
| Полиовирус | Picornaviridae | Линейная одноцепочечная РНК (+) | Как и у вируса краснухи, геном обладает положительной полярностью и сразу включается в трансляцию |
| SARS-CoV-2 | Coronaviridae | Линейная несегментированная одноцепочечная РНК (+) | Репликация осуществляется в цитоплазме с образованием отрицательного промежуточного шаблона |
| Аденовирусы | Adenoviridae | Линейная двуцепочечная ДНК | Диагностика основана на выявлении ДНК; геном не относится к РНК-вирусам |
| Ротавирус | Reoviridae | Двуцепочечная сегментированная РНК | Сегментированный геном и двуцепочечная РНК отличают его от вируса краснухи |
Положительная полярность генома не означает наличие двух цепей: геном вируса краснухи представлен только одной РНК-цепью. Во время репликации синтезируется комплементарная отрицательная цепь, но она является промежуточным матричным продуктом, а не самостоятельным сегментом генома. Для диагностики краснухи используют выявление вирусной РНК методом ОТ-ПЦР, а также обнаружение специфических IgM или сероконверсии и нарастания титра IgG. Таким образом, правильная характеристика генома — линейная одноцепочечная РНК положительной полярности.