1) защита прокариотической клетки от вирусов путем расщепления нуклеиновых кислот (+)
2) расщепление бактериальной геномной ДНК по кодируемым в CRISPR кассете последовательностям в процессе деления клетки
3) фрагментация ДНК эукариотической клетки в специфическом локусе для встраивания генома аденоассоциированных вирусов
4) расщепление плазмидной ДНК для встраивания кодируемых ими полезных для бактерии признаков в собственный геном