↑ Вверх ↓ Вниз

Предел чувствительности сравнительной геномной гибридизации на днк-микрочипах в детекции хромосомного мозаицизма при преимплантационном генетическом тестировании анеуплоидий оценивается на уровне (в %) (ответ на вопрос)

ПРЕДЕЛ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ СРАВНИТЕЛЬНОЙ ГЕНОМНОЙ ГИБРИДИЗАЦИИ НА ДНК-МИКРОЧИПАХ В ДЕТЕКЦИИ ХРОМОСОМНОГО МОЗАИЦИЗМА ПРИ ПРЕИМПЛАНТАЦИОННОМ ГЕНЕТИЧЕСКОМ ТЕСТИРОВАНИИ АНЕУПЛОИДИЙ ОЦЕНИВАЕТСЯ НА УРОВНЕ (В %)
1) 50
2) 10
3) 20
4) 40 (+)

Правильный ответ — 40%. При сравнительной геномной гибридизации на ДНК-микроматрице оценивается среднее количество генетического материала во всей исследуемой пробе. В биоптате трофэктодермы ДНК нормальных и анеуплоидных клеток объединяется, поэтому сигнал от патологического клона пропорционально разбавляется нормальной ДНК. При наличии примерно 40% анеуплоидных клеток изменение интенсивности сигнала обычно становится достаточным для уверенного распознавания мозаицизма.

Порог чувствительности не является универсальным биологическим пределом и зависит от типа анеуплоидии, размера хромосомного дисбаланса, качества амплификации генома, числа исследованных клеток и характеристик конкретной платформы. При более низкой доле патологических клеток результат может интерпретироваться как эуплоидный либо как пограничный, что создаёт риск ложноотрицательной оценки мозаицизма. Для отдельных лабораторных методик и при использовании NGS порог выявления может быть ниже, однако для классической aCGH в контексте ПГТ-А ориентировочным пределом считается около 40% анеуплоидных клеток.

Доля анеуплоидных клеток в биоптатеТипичный профиль aCGHДиагностическая интерпретация
0%Равномерный диплоидный профиль без достоверных отклонений дозыПризнаки мозаичной анеуплоидии отсутствуют в исследованном образце
Менее 20%Изменение сигнала обычно перекрывается аналитическим шумомМозаицизм чаще не выявляется методом aCGH
20–39%Небольшое или пограничное отклонение соотношения флуоресцентных сигналовВозможен мозаицизм, но достоверность результата ограничена
Около 40%Отклонение сигнала достигает уровня воспроизводимого обнаруженияОриентировочный предел чувствительности aCGH для мозаицизма
40–80%Устойчивое отклонение дозы соответствующей хромосомы или участкаМозаичный профиль обычно выявляется, степень мозаицизма оценивается полуколичественно
Более 80%Профиль близок к сплошной анеуплоидииВысокая доля анеуплоидных клеток; мозаичность может быть неотличима от преимущественно однородной анеуплоидии
Любая доля при некачественной амплификации или малом объёме биопсииПовышенный шум, вариабельность искажения сигналаВозрастает риск как ложноотрицательной, так и ложноположительной интерпретации

Результат aCGH отражает состав только исследованного фрагмента трофэктодермы и не всегда полностью характеризует клеточный состав внутренней клеточной массы эмбриона. Поэтому выявление мозаичного профиля требует оценки качества образца, характера хромосомного дисбаланса и лабораторных порогов интерпретации. При клиническом консультировании решение о дальнейшей тактике не основывается исключительно на одном числовом показателе мозаицизма.генетик

Поделитесь с коллегами ссылкой на наш сайт