2) реципрокные транслокации (+)
3) трисомию 13
4) трисомию 18
Молекулярное кариотипирование обычно выполняют методом хромосомного микроматричного анализа — array-CGH или SNP-микроarray. Метод оценивает изменения числа копий участков ДНК: делеции, дупликации и анеуплоидии. Поэтому увеличение числа целых хромосом, включая трисомии 13-й и 18-й хромосом, а также полисомии по половым хромосомам, приводит к изменению интенсивности сигнала и выявляется.
Сбалансированная реципрокная транслокация представляет собой обмен участками между двумя негомологичными хромосомами без суммарной потери или приобретения генетического материала. При сохранении эухроматинового содержания такой перестройке соответствует нормальный профиль числа копий, поэтому молекулярное кариотипирование ее не обнаруживает. Исключением могут быть случаи, когда в области разрыва возникает микроделеция, микродупликация или мозаицизм, однако сама сбалансированная транслокация остается вне возможностей метода.
Для диагностики сбалансированных транслокаций используют классическое цитогенетическое исследование с дифференциальным окрашиванием хромосом, а при необходимости — FISH или методы секвенирования, направленные на выявление точек разрыва. Таким образом, правильный ответ связан с принципиальным различием между анализом дозы генетического материала и выявлением структурной организации хромосом.
| Изменение | Что происходит с дозой ДНК | Выявление молекулярным кариотипированием | Предпочтительный метод подтверждения |
|---|---|---|---|
| Трисомия 13 | Прибавление полной копии 13-й хромосомы | Выявляется по увеличению сигнала по всей хромосоме | Микроматричный анализ, кариотипирование, QF-PCR |
| Трисомия 18 | Прибавление полной копии 18-й хромосомы | Выявляется как анеуплоидия | Микроматричный анализ или классическое кариотипирование |
| Полисомия по гоносомам | Избыточное число X- или Y-хромосом | Выявляется по изменению числа копий половых хромосом | Микроматричный анализ, кариотипирование, FISH |
| Сбалансированная реципрокная транслокация | Обмена участками без изменения общего количества ДНК | Обычно не выявляется | Кариотипирование с дифференциальным окрашиванием, FISH |
| Несбалансированная транслокация | Делеция и/или дупликация участков хромосом | Может выявляться как изменение числа копий | Микроматричный анализ с последующим кариотипированием |
| Микроделеция или микродупликация | Потеря или приобретение небольшого участка ДНК | Выявляется при размере изменения выше разрешения платформы | Микроматричный анализ, подтверждение FISH или MLPA |
Нормальный результат микроматричного анализа не исключает структурную хромосомную перестройку без изменения дозы генетического материала. Особенно важно учитывать это при обследовании пациентов с врожденными пороками развития, невынашиванием беременности или семейным анамнезом транслокаций. При подозрении на сбалансированную перестройку исследование следует дополнить стандартным кариотипированием. При выявлении у ребенка несбалансированного варианта целесообразно исследовать кариотип родителей для поиска сбалансированного носительства.