2) HCoV-OC43
3) SARS-CoV
4) SARS-CoV-2 (+)
Возбудителем COVID-19 является SARS-CoV-2 — оболочечный одноцепочечный РНК-содержащий вирус семейства Coronaviridae, рода Betacoronavirus, подрода Sarbecovirus. Он генетически родственен SARS-CoV, вызвавшему тяжелый острый респираторный синдром в 2002–2003 годах, однако представляет собой отдельный вид коронавируса и является причиной пандемической инфекции COVID-19.
Ключевой этап патогенеза — связывание поверхностного S-белка вируса с рецептором ангиотензинпревращающего фермента 2-го типа (ACE2) на клетках эпителия дыхательных путей, альвеолярных клетках, эндотелии и других тканях. После протеолитической активации S-белка вирус проникает в клетку и начинает репликацию. Клинические проявления варьируют от бессимптомного носительства и инфекций верхних дыхательных путей до вирусной пневмонии, острой дыхательной недостаточности и системных тромботических осложнений.
Лабораторное подтверждение острой инфекции основано прежде всего на обнаружении РНК SARS-CoV-2 методом амплификации нуклеиновых кислот, преимущественно ОТ-ПЦР, в мазках из носоглотки, ротоглотки или образцах из нижних дыхательных путей. Экспресс-тесты выявляют вирусный антиген и наиболее информативны при высокой вирусной нагрузке; отрицательный результат при сохраняющемся клиническом подозрении не исключает инфекцию. Серологическое исследование отражает иммунный ответ и обычно не используется как единственный критерий ранней диагностики.
| Вирус | Таксономическая характеристика | Основное заболевание | Диагностическое значение |
|---|---|---|---|
| SARS-CoV-2 | Betacoronavirus, подрод Sarbecovirus | COVID-19; возможны пневмония, ОРДС и системные осложнения | РНК выявляется методом ОТ-ПЦР или другим NAAT; антигенные тесты выявляют вирусный нуклеопротеин |
| SARS-CoV | Betacoronavirus, подрод Sarbecovirus | Тяжелый острый респираторный синдром SARS, вспышка 2002–2003 годов | Не является возбудителем COVID-19; лабораторная идентификация проводится отдельными специфическими тестами |
| HCoV-HKU1 | Betacoronavirus, подрод Embecovirus | Обычно сезонная инфекция верхних дыхательных путей; у групп риска возможна пневмония | Не выявляется стандартными тестами, предназначенными для SARS-CoV-2, если они не входят в мультиплексную панель |
| HCoV-OC43 | Betacoronavirus, подрод Embecovirus | Чаще вызывает нетяжелую ОРВИ, реже — поражение нижних дыхательных путей | Относится к сезонным коронавирусам и не является причиной пандемии COVID-19 |
| Рецептор и проникновение | SARS-CoV-2 и SARS-CoV используют ACE2; активация S-белка обеспечивается протеазами клетки | Определяет тропность к эпителию дыхательных путей и другим ACE2-экспрессирующим клеткам | Молекулярный механизм подтверждает принадлежность SARS-CoV-2 к коронавирусам Sarbecovirus, но не заменяет лабораторную диагностику |
| Критерий подтверждения COVID-19 | Обнаружение специфической РНК или антигена SARS-CoV-2 в клиническом материале | Клинические симптомы и эпидемиологический анамнез оцениваются в совокупности с тестированием | Положительный результат валидированного NAAT является наиболее чувствительным подтверждением текущей инфекции |
Таким образом, решающим признаком является видовая принадлежность возбудителя: COVID-19 вызывается именно SARS-CoV-2, а не другими сезонными коронавирусами или SARS-CoV. Наличие общих рецепторов и сходство клинических проявлений не означает идентичности вирусов. Дифференциация проводится с помощью специфических молекулярных или антигенных тестов.