↑ Вверх ↓ Вниз

Механизмы геномных тестов в панелях, рекомендованных ajcc 8 пересмотра, основаны на реакции (ответ на вопрос)

МЕХАНИЗМЫ ГЕНОМНЫХ ТЕСТОВ В ПАНЕЛЯХ, РЕКОМЕНДОВАННЫХ AJCC 8 ПЕРЕСМОТРА, ОСНОВАНЫ НА РЕАКЦИИ
1) спектрофотометрии
2) ПЦР
3) антиген-антитело (+)
4) in-situ гибридизации

В контексте биомаркерных исследований, учитываемых при стадировании по AJCC 8-го пересмотра, отмеченный ответ соответствует иммуногистохимическому методу. Его основа — специфическое связывание антитела с антигеном, то есть с определённым белком в опухолевой клетке. Связанный первичный антителом комплекс выявляют с помощью ферментной цветной реакции или флуоресцентной метки; результат оценивают по интенсивности окрашивания, проценту позитивных клеток и характеру внутриклеточной локализации.

Иммуногистохимия имеет принципиальное значение для определения экспрессии ER, PR и HER2 при раке молочной железы, p16 как суррогатного маркера HPV-ассоциированного рака ротоглотки, а также белков системы репарации неспаренных оснований при подозрении на микросателлитную нестабильность. Полученные данные могут влиять на прогностическую группу и выбор лечебной тактики. При этом в строгом смысле иммуногистохимия не является исследованием последовательности ДНК: она оценивает белковый продукт гена. Поэтому термин геномные тесты в формулировке следует понимать расширенно — как комплекс молекулярно-биомаркерных исследований, применяемых в современных классификациях опухолей.

Другие методы используют иные физико-химические принципы. ПЦР и секвенирование анализируют нуклеиновые кислоты посредством амплификации или определения последовательности, а in situ-гибридизация выявляет комплементарные участки ДНК или РНК непосредственно в клетке. Спектрофотометрия измеряет оптические характеристики образца и сама по себе не обеспечивает специфического распознавания опухолевого белка. Для HER2, например, иммуногистохимия оценивает гиперэкспрессию белка, а при сомнительном результате назначают in situ-гибридизацию для подтверждения амплификации гена.

МетодОсновной объект исследованияМеханизмПримеры диагностического примененияКлючевая особенность
ИммуногистохимияБелки и антигены клетокСпецифическая реакция антиген–антитело с ферментной или флуоресцентной визуализациейER, PR, HER2, p16, белки MMRПоказывает экспрессию белка и его локализацию в ткани
ПЦРДНК или РНКАмплификация выбранного участка нуклеиновой кислоты праймерамиВыявление мутаций, вирусной ДНК/РНК, транслокацийВысокая аналитическая чувствительность, но обычно без оценки тканевой локализации
Секвенирование нового поколенияМножество участков геномаМассивное параллельное определение последовательности нуклеотидовПанели соматических мутаций, копийных нарушений и генов слиянияПозволяет одновременно исследовать большое число генов
In situ-гибридизацияДНК или РНК в клетках и тканевых срезахГибридизация меченого зонда с комплементарной нуклеотидной последовательностьюАмплификация HER2, вирусные последовательности, некоторые транслокацииСочетает молекулярную специфичность с сохранением морфологического контекста
СпектрофотометрияОптические свойства раствора или образцаИзмерение поглощения или пропускания света на определённой длине волныОценка концентрации веществ, контроль качества экстрактовНе основана на специфическом распознавании конкретного антигена
Комбинированная стратегияБелковый и генетический уровниПоследовательное применение ИГХ и молекулярного подтверждающего тестаHER2: ИГХ с последующей ISH при сомнительном результатеПовышает точность классификации и клинической стратификации опухоли

Таким образом, реакция антиген–антитело является фундаментом иммуногистохимической части биомаркерной диагностики, включаемой в современные онкологические классификации. Она позволяет связать морфологическую картину опухоли с экспрессией клинически значимых белков. Генетические изменения при необходимости подтверждают ПЦР, секвенированием или in situ-гибридизацией. Корректный выбор метода зависит от того, требуется ли определить белковую экспрессию, нуклеотидную последовательность, амплификацию гена или клеточную локализацию молекулярного маркера.

Поделитесь с коллегами ссылкой на наш сайт