↑ Вверх ↓ Вниз

Расчет вероятности случайного совпадения генотипов в локусе se33 по формуле q = 2 p23.2×p25.2 будет корректен в том случае, если в следе слюны (ответ на вопрос)

РАСЧЕТ ВЕРОЯТНОСТИ СЛУЧАЙНОГО СОВПАДЕНИЯ ГЕНОТИПОВ В ЛОКУСЕ SE33 ПО ФОРМУЛЕ Q = 2 p23.2×p25.2 БУДЕТ КОРРЕКТЕН В ТОМ СЛУЧАЕ, ЕСЛИ В СЛЕДЕ СЛЮНЫ
1) и образце подозреваемой установлены аллели 23.2, 25.2 (+)
2) установлен многоаллельный профиль (более двух аллелей), содержащий аллели 23.2 и 25.2, в образце подозреваемой установлен генотип 23.2, 25.2
3) установлен генотип 23.2, 23.2, в образце подозреваемой – 25.2, 25.2
4) и образце подозреваемой установлены аллели 25.2, 25.2

Правильный ответ — вариант 1: в следе слюны и образце подозреваемой выявлен один и тот же полный однолокусный генотип 23.2, 25.2. Локус SE33 является аутосомным высокополиморфным STR-маркером с кодоминантным наследованием, поэтому у гетерозиготы учитываются оба аллеля. При равновесии Харди—Вайнберга и отсутствии родства между лицами частота случайного появления такого неупорядоченного генотипа определяется как Q = 2 × p23.2 × p25.2; множитель 2 учитывает два возможных порядка сочетания аллелей.

Если в следе обнаружено более двух аллелей, это рассматривается как смешанный профиль, а не как генотип одного человека; для него требуются вероятностная интерпретация смеси, оценка числа доноров и расчет отношения правдоподобия. Для гомозиготного генотипа применяют выражение p2, поэтому при совпадении по аллелю 25.2 корректной была бы величина p25.22, а не приведенная формула. Различные гомозиготные генотипы в следе и образце подозреваемой не являются совпадающими профилями по SE33.

СитуацияГенотип или профильРасчетИнтерпретация
Одноисточниковый профиль с совпадением23.2, 25.2 в следе и образцеQ = 2 × p23.2 × p25.2Корректная оценка частоты случайного совпадения гетерозиготного генотипа
Любой гетерозиготный генотипa, b, где a ≠ b2 × pa × pbПрименяется при полном и однозначно установленном профиле одного лица
Гомозигота по аллелю 23.223.2, 23.2p23.22Множитель 2 не используется, поскольку аллели одинаковы
Гомозигота по аллелю 25.225.2, 25.2p25.22Иная формула частоты, чем для гетерозиготы 23.2/25.2
Смешанный профильБолее двух аллелей, включая 23.2 и 25.2Простая формула 2papb неприменимаНеобходимы моделирование смеси, учет доноров, выпадения аллелей и артефактов STR
Несовпадающие генотипыВ следе 23.2/23.2, у подозреваемой 25.2/25.2Расчет случайного совпадения этих генотипов не проводитсяПри достоверном одноисточниковом профиле выявляется несовместимость по локусу
Совокупность нескольких локусовСовпадающие профили по независимым маркерамЧастоты комбинируют с учетом независимости локусовИтоговая статистическая оценка не равна частоте одного локуса SE33

Значения частот аллелей получают из валидированной популяционной базы данных, соответствующей исследуемой популяции. Показатель случайного совпадения отражает частоту генотипа у случайного неродственного человека, но не является вероятностью виновности или невиновности подозреваемой. При родстве, популяционной структуре, редких аллелях и низкокопийной ДНК необходимы специальные поправки и вероятностная интерпретация.

Поделитесь с коллегами ссылкой на наш сайт