↑ Вверх ↓ Вниз

Расчет вероятности случайного совпадения генотипов в локусе d3s1358 по формуле q = p192 будет корректен в том случае, если в следе слюны (ответ на вопрос)

РАСЧЕТ ВЕРОЯТНОСТИ СЛУЧАЙНОГО СОВПАДЕНИЯ ГЕНОТИПОВ В ЛОКУСЕ D3S1358 ПО ФОРМУЛЕ Q = p192 БУДЕТ КОРРЕКТЕН В ТОМ СЛУЧАЕ, ЕСЛИ В СЛЕДЕ СЛЮНЫ
1) и образце подозреваемого установлены аллели 19, 19 (+)
2) и образце подозреваемого установлены аллели 19, 20
3) установлен генотип 19, 19, в образце подозреваемого – 20, 20
4) установлен многоаллельный профиль (более двух аллелей), содержащий аллель 19, в образце подозреваемого установлен генотип 19, 19

Отмеченный вариант верен, поскольку локус D3S1358 является аутосомным STR-маркером, а при совпадении у исследуемого следа и образца подозреваемого гомозиготного генотипа 19,19 частота такого генотипа в популяции рассчитывается по формуле Харди—Вайнберга: Q = p192. Здесь p19 — частота аллеля 19 в соответствующей референтной популяции. Возведение частоты аллеля в квадрат отражает получение двух одинаковых копий аллеля — по одной от каждого из родителей.

Формула применима только к совпадающему генотипу одного источника биологического материала при корректно установленном профиле и соблюдении популяционно-генетических допущений. Для гетерозиготы 19,20 используется выражение 2p19p20, поскольку возможны два порядка наследования аллелей. Несовпадение генотипов 19,19 и 20,20 исключает совпадение на данном локусе, а наличие более двух аллелей обычно указывает на смешанный след либо требует исключения артефактов амплификации; в такой ситуации простая формула для гомозиготного профиля неприменима.

Расчет Q характеризует вероятность случайного обнаружения такого же генотипа у случайно выбранного неродственного человека, но не является вероятностью виновности подозреваемого и не заменяет совокупную оценку доказательств. Для полного ДНК-профиля частоты по независимым локусам обычно объединяют путем перемножения, если подтверждена независимость маркеров и учтены особенности референтной популяции.

СитуацияГенотип или профильРасчет на локусеИнтерпретация
Совпадающий гомозиготный профильСлед 19,19; образец 19,19Q = p192Корректная формула для вероятности случайного совпадения генотипа
Совпадающий гетерозиготный профиль19,20 у обоих образцовQ = 2p19p20Учитываются два возможных варианта наследования аллелей
Совпадающий генотип с другим аллелем20,20 у обоих образцовQ = p202Применяется аналогично, но используется частота аллеля 20
Несовпадение профилейСлед 19,19; образец 20,20Совпадение на локусе отсутствуетГенетическое исключение общего источника по данному маркеру, если результаты достоверны
Смешанный или многоаллельный следБолее двух аллелей, включая 19Простая формула p192 не используетсяТребуется анализ смеси, вкладов доноров, стуттер-пиков и иных артефактов
Совокупный многолокусный профильСовпадение по нескольким независимым STR-локусамПроизведение частот генотипов по локусамПолучают значительно более низкую вероятность случайного совпадения при соблюдении условий независимости

Таким образом, показатель p192 относится именно к совпадению гомозиготного генотипа 19,19 в следе и сравнительном образце. Частота аллеля должна быть взята из валидированной базы для популяции, к которой обоснованно отнесен объект исследования. При интерпретации смешанных профилей необходимы специальные вероятностные модели, а не формулы для простого двухаллельного генотипа.

Поделитесь с коллегами ссылкой на наш сайт