2) один (Австралийский)
3) три (Восточно-Африканский, Западно-Африканский, Азиатский) (+)
4) два (Индийский, Пакистанский)
Вирус Зика (ZIKV) относится к роду Orthoflavivirus семейства Flaviviridae и представляет собой оболочечный вирус с одноцепочечной РНК положительной полярности. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей, особенно участка, кодирующего полипротеин, выделяет три основные генетические линии, традиционно обозначаемые как восточноафриканская, западноафриканская и азиатская. Поэтому правильным является ответ о трех известных генотипах.
Восточно- и западноафриканские линии связаны преимущественно с циркуляцией вируса в Африке, тогда как азиатская линия включает штаммы, распространившиеся в островных государствах Тихого океана и на Американском континенте. Внутри каждой линии существуют генетические клады и региональные варианты, однако их наличие не меняет базовую учебную классификацию на три генотипа. Генотипирование проводят методами секвенирования и последующего филогенетического анализа; стандартная ПЦР в реальном времени подтверждает наличие РНК вируса, но обычно не определяет его генотип.
| Критерий | Характеристика |
|---|---|
| Восточноафриканская линия | Одна из трех основных филогенетических линий ZIKV; генетически отличается от западноафриканской и азиатской. |
| Западноафриканская линия | Самостоятельная африканская линия, выявляемая при сравнении полных геномов или консервативных участков вирусной РНК. |
| Азиатская линия | Включает эпидемически значимые штаммы, вызвавшие вспышки в Океании и странах Америки. |
| Основной метод классификации | Сравнение нуклеотидных последовательностей и построение филогенетического дерева; географическое происхождение само по себе не является достаточным критерием. |
| Рутинное выявление инфекции | Обнаружение РНК ZIKV методом ОТ-ПЦР в крови, моче или других клинических образцах с учетом сроков вирусемии. |
| Серологическая диагностика | Определение IgM возможно, но интерпретация ограничена перекрестными реакциями с антителами к вирусам денге и другим флавивирусам; при необходимости используют нейтрализационные тесты. |
| Клиническое значение генотипа | Генотип не используется как самостоятельный критерий постановки диагноза и обычно не определяет тактику лечения; заболевание чаще протекает как лихорадка, экзантема, конъюнктивит и артралгии. |
Генетические различия между линиями имеют прежде всего эпидемиологическое и эволюционное значение. Клиническая настороженность особенно важна при беременности, поскольку инфекция может быть связана с врожденными аномалиями плода, включая микроцефалию. Специфической противовирусной терапии и лицензированной вакцины против инфекции, вызванной ZIKV, в стандартной практике нет; лечение преимущественно симптоматическое. Таким образом, число трех отражает принятую филогенетическую классификацию, а не количество клинических форм заболевания.