2) линейная молекула ДНК равная одному вирусному геному (+)
3) одна кольцевая молекула ДНК, равная одному вирусному геному
4) линейная молекула дцРНК, равная одному вирусному геному
Конкатемер — это длинная молекула вирусной нуклеиновой кислоты, содержащая несколько последовательно соединённых копий генома, обычно расположенных по типу голова к хвосту . Поэтому отмеченный вариант № 2 сформулирован некорректно: признак линейной ДНК может соответствовать конкатемеру, но длина такой молекулы не равна одной геномной единице, а кратна ей и составляет n копий вирусного генома. Корректная формулировка должна указывать на линейную молекулу ДНК, состоящую из повторяющихся геномных единиц.
Конкатемеры образуются в процессе репликации ряда ДНК-содержащих вирусов, в том числе герпесвирусов и некоторых бактериофагов. Один из механизмов их формирования связан с репликацией по типу катящегося кольца : после образования промежуточной кольцевой формы матрицы синтезируется длинная цепь ДНК с многократным повторением вирусного генома. При созревании вирусных частиц фермент упаковки распознаёт сигналы упаковки, разрезает конкатемер на фрагменты геномной длины, после чего отдельные копии включаются в капсиды.
Конкатемер нельзя отождествлять с фрагментом Оказаки, который представляет собой короткий участок вновь синтезированной ДНК на отстающей цепи репликативной вилки. Одна кольцевая молекула геномной ДНК соответствует самостоятельной геномной единице, а линейная двухцепочечная РНК — типу генома некоторых РНК-вирусов, но не конкатемеру вирусной ДНК.
| Структура | Молекулярная организация | Основное значение | Отличительный признак |
|---|---|---|---|
| Конкатемер | Линейная ДНК с несколькими тандемными копиями вирусного генома | Промежуточный продукт репликации и субстрат для упаковки | Длина кратна размеру одной геномной единицы |
| Геномная единица | Одна полная копия вирусного генома | Функциональная и упаковочная единица вируса | Содержит одну, а не несколько последовательных копий генома |
| Фрагмент Оказаки | Короткий участок новосинтезированной ДНК | Обеспечивает синтез отстающей цепи при репликации | Удаляется или соединяется ДНК-лигазой; не является вирусным геномом |
| Кольцевая вирусная ДНК | Замкнутая молекула с одной или несколькими копиями генома | Может служить репликативным промежуточным продуктом | Отсутствуют свободные концы линейной молекулы |
| Линейная дцРНК | Двухцепочечная РНК с линейной организацией | Геном или сегмент генома РНК-содержащих вирусов | Химически отличается от ДНК наличием рибозы и урацила |
| Упакованный вирусный геном | Обычно одна геномная единица после разрезания конкатемера | Передача наследственного материала вирусной частице | Размер соответствует пределам вместимости капсида |
При молекулярном анализе конкатемер распознают по наличию повторяющихся участков, размер которых кратен длине вирусного генома. Для подтверждения такой организации применяют рестрикционное картирование, гибридизацию, электрофорез длинных молекул ДНК или секвенирование длинных прочтений. В тестовом задании ключ следует исправить: правильным является определение конкатемера как линейной ДНК с многократным повторением геномной единицы, а не как молекулы, равной одному вирусному геному.