2) двуцепочечную линейную ДНК (+)
3) одноцепочечную сегментированную РНК
4) одноцепочечную линейную ДНК
Цитомегаловирус человека (HCMV, HHV-5) относится к семейству Herpesviridae, подсемейству Betaherpesvirinae. Его геном представлен крупной двуцепочечной линейной молекулой ДНК размером приблизительно 230–240 тыс. пар оснований. В составе генома выделяют уникальные и повторяющиеся участки; он не сегментирован, то есть не разделён на несколько самостоятельных фрагментов.
Линейная ДНК находится в составе зрелого вириона, а после проникновения в клетку доставляется в ядро. В процессе репликации геном может циркуляризоваться и существовать в виде эписомы, что имеет значение для установления латентной инфекции; при этом структурная характеристика вирусного генома остаётся двуцепочечной ДНК. Репликация осуществляется в ядре инфицированной клетки с участием вирусной ДНК-полимеразы и сопровождается синтезом ранних и поздних вирусных белков.
Именно наличие ДНК определяет основной лабораторный подход — выявление генома HCMV методом ПЦР в крови, моче, слюне, ликворе или других клинических образцах. Обнаружение ДНК само по себе не всегда свидетельствует об активном заболевании, поэтому результат оценивают с учётом вирусной нагрузки, клинических проявлений и иммунного статуса пациента.
| Признак | Цитомегаловирус человека | Диагностическое и биологическое значение |
|---|---|---|
| Тип нуклеиновой кислоты | ДНК | Геном выявляют молекулярными методами, прежде всего ПЦР; противовирусная терапия направлена на вирусные ферменты репликации ДНК. |
| Структура цепи | Двуцепочечная | Относится к характерному признаку герпесвирусов и отличает HCMV от большинства респираторных и кишечных РНК-вирусов. |
| Форма генома в вирионе | Линейная | Линейная ДНК упаковывается в капсид зрелой вирусной частицы; после проникновения в ядро возможна её циркуляризация. |
| Сегментация | Несегментированный геном | Генетическая информация не распределена между несколькими независимыми сегментами, как у вирусов гриппа. |
| Размер и организация | Около 230–240 кб; уникальные области и терминальные повторы | Большой геном кодирует структурные белки, ферменты репликации и белки, регулирующие иммунный ответ и латентность. |
| Место репликации | Ядро инфицированной клетки | Формируются внутриядерные репликационные компартменты и характерные включения; ядерная локализация типична для герпесвирусов. |
| Основной метод обнаружения | ПЦР с количественной оценкой ДНК | Количественный результат помогает оценивать активность инфекции и эффективность терапии, особенно у пациентов с иммунодефицитом. |
Геномная организация HCMV является одним из оснований для его отнесения к герпесвирусам, несмотря на значительные различия между представителями этого семейства. Латентная инфекция сохраняется преимущественно в клетках миелоидного ряда и может реактивироваться при иммуносупрессии. Наиболее тяжёлые формы цитомегаловирусной инфекции наблюдаются у реципиентов трансплантатов, пациентов с ВИЧ-инфекцией и внутриутробно инфицированных детей. Для лечения применяют препараты, подавляющие вирусную ДНК-полимеразу, включая ганцикловир и валганцикловир.