2) B
3) A
4) F (+)
Наиболее распространённым генетическим вариантом вируса эпидемического паротита в Российской Федерации является генотип F. Такое заключение основано на результатах молекулярно-эпидемиологического надзора и филогенетического анализа вирусных изолятов, полученных от больных и контактных лиц. Генотипирование обычно проводят по последовательности гена SH, кодирующего малый гидрофобный белок вируса; для уточнения родства штаммов могут использоваться расширенные участки генома или полногеномное секвенирование.
Генетическое разнообразие вируса формируется вследствие ошибок РНК-зависимой РНК-полимеразы при репликации и последующего распространения отдельных линий в популяции. Генотип F не является отдельным серотипом и сам по себе не определяет наличие или тяжесть паротита: клинические проявления включают болезненное увеличение околоушных слюнных желёз, лихорадку, интоксикацию, а при осложнённом течении — орхит, менингит или панкреатит. Для подтверждения острой инфекции применяют обнаружение РНК вируса методом ОТ-ПЦР в буккальном или слюнном материале, преимущественно в первые дни заболевания, а также выявление специфических IgM или нарастания титра IgG в парных сыворотках.
| Параметр | Характеристика | Практическое значение |
|---|---|---|
| Генотип F | Преобладающая генетическая линия вируса паротита, выявляемая при молекулярном надзоре в РФ | Маркер циркуляции местных и заносных эпидемических цепочек |
| Генотип A | Включает референсный вакцинный штамм Jeryl Lynn | Позволяет отличать вакцинные штаммы от большинства циркулирующих диких вариантов при секвенировании |
| Генотипы G и другие | Могут доминировать в отдельных странах и временных периодах, формируя региональные вспышки | Географическое распределение генотипов используется для установления источника и направления передачи инфекции |
| Ген D | Один из ранее описанных генетических вариантов вируса паротита | Сам факт выявления этого генотипа не означает его преобладания на современной территории РФ |
| Ген SH | Стандартный участок генома для рутинного генотипирования вируса паротита | Сопоставление последовательностей позволяет построить филогенетическое дерево и определить генотип |
| ОТ-ПЦР | Выявляет РНК вируса в клиническом материале | Подтверждает текущую инфекцию, но без последующего секвенирования не устанавливает генотип |
| Серологическая диагностика | Определение IgM или диагностически значимого прироста IgG | Подтверждает иммунный ответ на инфекцию; серология не используется для различения генотипов |
Генотипирование имеет прежде всего эпидемиологическое значение: оно помогает связать случаи заболевания в одну цепь передачи и выявить занос инфекции. Для оценки эффективности вакцинации учитывают не совпадение генотипов, а наличие защитного иммунитета и предупреждение заболевания; вирус паротита относится к одному серотипу. При вспышке решающее значение сохраняют раннее лабораторное подтверждение, изоляция больных, наблюдение за контактными лицами и анализ прививочного статуса.