2) 24 хромосомы (+)
3) 46 хромосом
4) 47 хромосом
Правильный ответ — 24 хромосомы. При NGS-анализе оцениваются все 22 аутосомы и обе половые хромосомы — X и Y. Число 24 обозначает количество различных хромосомных мишеней, охватываемых исследованием, а не общее число хромосомных копий в диплоидной клетке. Поэтому варианты 46 и 47 отражают возможное количество отдельных хромосом в клетке, но не число хромосом, указываемое при комплексном хромосомном скрининге.
Для ПГТ на анеуплоидии, или PGT-A, обычно исследуют несколько клеток трофэктодермы бластоцисты. После полногеномной амплификации из полученной ДНК формируют библиотеку, выполняют параллельное секвенирование и сопоставляют прочитанные фрагменты с референсным геномом. Относительное количество прочтений, приходящихся на каждую хромосому и ее участки, позволяет оценить дозу генетического материала и выявить моносомии, трисомии, крупные делеции или дупликации.
NGS обеспечивает комплексную оценку хромосомного набора, в отличие от FISH, при которой анализ ограничен локусами, соответствующими выбранным флуоресцентным зондам. При исследовании нескольких клеток промежуточное соотношение числа прочтений может указывать на предполагаемый мозаицизм — наличие в биоптате клеточных линий с различным хромосомным составом. Интерпретация зависит от разрешающей способности и валидированных порогов конкретной лаборатории; результат PGT-A является скрининговым и не заменяет пренатальную диагностику.
| Метод или оцениваемый параметр | Диагностические возможности | Основные ограничения |
|---|---|---|
| NGS при PGT-A | Одновременная оценка числа копий всех 24 хромосом: 1–22, X и Y | Результат характеризует исследованный биоптат трофэктодермы, а не каждую клетку эмбриона |
| Целая хромосомная анеуплоидия | Выявление моносомий и трисомий по снижению или увеличению относительного количества прочтений | Точность зависит от качества амплификации, секвенирования и биоинформатического анализа |
| Сегментарный дисбаланс | Обнаружение крупных делеций и дупликаций отдельных участков хромосом | Минимальный размер выявляемого изменения определяется разрешением платформы |
| Предполагаемый мозаицизм | Промежуточный профиль копий может отражать смесь эуплоидных и анеуплоидных клеток | Уровень мозаицизма является расчетной оценкой и может различаться между лабораториями |
| Анализ методом aCGH | Также охватывает все 24 хромосомы и выявляет изменения количества генетического материала | Обычно уступает современному NGS по динамическому диапазону и возможностям оценки низкоуровневого мозаицизма |
| FISH | Исследует только хромосомы или локусы, для которых применены специальные зонды | Не обеспечивает полноценного анализа всех 24 хромосом и не рекомендуется как основной метод PGT-A |
| Сбалансированная перестройка | NGS выявляет несбалансированные делеции и дупликации, связанные с перестройкой | Стандартный анализ числа копий обычно не различает нормальный кариотип и сбалансированное носительство |
Понятие 24-хромосомный анализ является лабораторным обозначением полного охвата хромосомных мишеней, а не описанием кариотипа отдельной клетки. Эуплоидный результат означает отсутствие выявленного числового или доступного разрешению сегментарного дисбаланса в исследованной пробе. Из-за возможного эмбрионального мозаицизма, ошибок амплификации и ограничений метода ПГТ не гарантирует отсутствие всех генетических заболеваний. После наступления беременности пациентам следует предлагать генетическое консультирование и обсуждение методов пренатального скрининга или инвазивной диагностики.