2) выявляются только сбалансированные хромосомные аберрации
3) выявляются только численные хромосомные аберрации
4) анализируется весь кариотип (+)
Стандартное цитогенетическое исследование анализирует весь кариотип, то есть полный набор хромосом клетки: их число, размеры, форму, положение центромер и характер дифференциального окрашивания. Обычно исследуют метафазные пластинки после культивирования клеток и остановки митоза; хромосомы располагают в гомологичные пары и оценивают последовательно во всех парах. Поэтому метод позволяет выявлять не один определённый тип изменений, а совокупность крупных численных и структурных нарушений генома.
При таком анализе обнаруживаются анеуплоидии и полиплоидии, а также значимые по размеру делеции, дупликации, инверсии, транслокации и маркерные хромосомы. Структурные перестройки могут быть сбалансированными, когда суммарный объём генетического материала не изменён, или несбалансированными — с его утратой либо добавлением. Классический кариотип особенно информативен при лейкозах и других опухолях кроветворной системы, например для выявления транслокации t(9;22)(q34;q11.2), однако его разрешающая способность обычно ограничена изменениями размером примерно 5–10 Мб и более.
Исследование имеет общегеномный характер, но требует наличия делящихся клеток и достаточного числа качественных метафаз. Мелкие микроделеции, точечные мутации и субмикроскопические перестройки могут оставаться невыявленными; для их обнаружения применяют FISH, хромосомный микроматричный анализ или методы секвенирования. Таким образом, правильным является утверждение об анализе полного кариотипа, а не ограничении метода только численными или только структурными либо сбалансированными аберрациями.
| Объект оценки | Что выявляет стандартное исследование | Примеры | Диагностическое значение |
|---|---|---|---|
| Число хромосом | Изменения плоидности и количества отдельных хромосом | Трисомия, моносомия, полиплоидия | Позволяет установить численную аномалию и оценить клональность процесса |
| Структура хромосом | Крупные перестройки, различимые по морфологии и полосатости | Делеция, дупликация, инверсия, транслокация | Характеризует геномные изменения и может иметь прогностическое значение |
| Сбалансированные перестройки | Перестройки без видимой потери или приобретения материала | Реципрокная транслокация, инверсия | Особенно важны для диагностики опухолевых клонов и оценки риска нарушений у потомства |
| Несбалансированные перестройки | Изменения с утратой или избытком хромосомного материала | Терминальная делеция, дополнительный сегмент, дериватная хромосома | Часто связаны с фенотипическими проявлениями и неблагоприятными биологическими признаками |
| Мозаицизм | Различающиеся кариотипы в отдельных клеточных клонах | Нормальный и аномальный клоны в одном образце | Выявление зависит от числа исследованных метафаз и доли патологического клона |
| Разрешающая способность | Крупные изменения, видимые при микроскопическом анализе | Перестройки обычно размером около 5–10 Мб и более | Мелкие дефекты требуют FISH, микроматричного анализа или секвенирования |
| Объём исследования | Все хромосомы клеточного набора оцениваются одновременно | Полный кариотип с числовой записью и описанием перестроек | Метод имеет общегеномный, а не локальный характер |
Результат оформляют в соответствии с международной номенклатурой ISCN, указывая число хромосом, половые хромосомы и выявленные перестройки. В онкогематологии кариотипирование помогает подтвердить наличие цитогенетического клона и стратифицировать заболевание по прогностическим группам. Отрицательный результат не исключает генетическую патологию, если изменения имеют микроскопически малый размер или клетки не вступают в деление. Выбор дополнительных молекулярно-генетических методов определяется клинической задачей и предполагаемой аномалией.