↑ Вверх ↓ Вниз

Метод секвенирования днк разработал (ответ на вопрос)

МЕТОД СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДНК РАЗРАБОТАЛ
1) П.Эдман
2) Д.Уотсон
3) Ф. Сэнгер (+)
4) Ф.Крик

Правильный ответ — Ф. Сэнгер. В 1977 году Фредерик Сэнгер разработал ферментативный метод секвенирования ДНК, известный как метод обрыва цепи или дидезокси-метод. Его принцип заключается в синтезе комплементарной цепи ДНК с использованием матрицы, праймера, ДНК-полимеразы и смеси обычных дезоксинуклеотидтрифосфатов с дидезоксинуклеотидами.

Дидезоксинуклеотиды не имеют 3′-гидроксильной группы, необходимой для присоединения следующего нуклеотида, поэтому их включение приводит к прекращению синтеза цепи. Образуется набор фрагментов различной длины, заканчивающихся определённым нуклеотидом; после разделения фрагментов электрофорезом и регистрации флуоресцентных меток восстанавливается последовательность ДНК. Современная автоматизированная версия метода применяется для подтверждения вариантов, выявленных при массовом параллельном секвенировании, а также для анализа отдельных генов и небольших участков генома.

МетодОсновной принципХарактеристика и область применения
Секвенирование по СэнгеруОбрыв синтеза цепи при включении флуоресцентно меченого дидезоксинуклеотидаВысокая точность; обычно анализируют один амплифицированный фрагмент длиной до примерно 700–1000 пар оснований
Метод Максама—ГилбертаХимическая модификация и избирательное расщепление ДНКИсторический метод первого поколения, практически вытеснен ферментативным секвенированием
Секвенирование IlluminaСинтез с обратимым терминатором и массовая регистрация флуоресцентных сигналовМассовое параллельное секвенирование коротких прочтений; используется для поиска множества вариантов
ПиросеквенированиеРегистрация пирофосфата, высвобождаемого при присоединении нуклеотидаБыстрый анализ относительно коротких последовательностей, но ограниченная точность в гомополимерных участках
PacBio HiFiМногократное считывание одной молекулы в режиме реального времениДлинные высокоточные прочтения; полезно для структурных вариантов и сборки генома
Oxford NanoporeИзмерение изменения электрического тока при прохождении ДНК через нанопоруОчень длинные прочтения и возможность портативного анализа; точность зависит от платформы и алгоритмов обработки

Метод Сэнгера относится к секвенированию первого поколения и сохраняет значение благодаря высокой аналитической точности. В медицинской генетике его часто используют для верификации патогенного варианта и уточнения последовательности после ПЦР. Ограничением метода являются невысокая пропускная способность и невозможность экономично исследовать большие объёмы генетического материала.

Поделитесь с коллегами ссылкой на наш сайт