2) бифидобактерии, эшерихии (+)
3) грибы рода Candida, бордетеллы
4) стрептококки, шигеллы
Бифидобактерии относятся к облигатной, преимущественно анаэробной микробиоте толстой кишки и составляют важную часть ее защитного микробного сообщества. Они участвуют в ферментации пищевых субстратов, образовании короткоцепочечных жирных кислот, поддержании кислой среды и колонизационной резистентности — способности нормальной микробиоты препятствовать закреплению и размножению патогенных микроорганизмов.
Эшерихии, прежде всего непатогенные штаммы Escherichia coli, являются факультативно-анаэробными представителями резидентной микробиоты, хотя количественно значительно уступают строгим анаэробам. Они потребляют остаточный кислород, способствуя формированию анаэробных условий, синтезируют отдельные витамины и участвуют в метаболических взаимодействиях микробного сообщества. При лабораторной оценке необходимо различать комменсальные эшерихии и патогенные варианты, несущие факторы вирулентности и способные вызывать кишечные инфекции.
| Группа микроорганизмов | Примеры | Статус в толстой кишке | Дифференциальный признак |
|---|---|---|---|
| Облигатные анаэробы | Bifidobacterium, Bacteroides, представители порядка Clostridiales | Основная резидентная микробиота | Преобладают количественно, участвуют в ферментации и образовании короткоцепочечных жирных кислот |
| Факультативные анаэробы | Непатогенные штаммы Escherichia coli | Нормальный, но малочисленный компонент | Рост возможен как при наличии, так и при отсутствии кислорода; патогенность определяется серотипом и генами вирулентности |
| Условно-патогенные бактерии | Некоторые стафилококки и стрептококки | Могут присутствовать в небольшом количестве | Клиническое значение приобретают при избыточном росте, иммунодефиците или нарушении барьерной функции |
| Дрожжеподобные грибы | Candida spp. | Допустимы как малочисленные комменсалы | Само обнаружение не подтверждает кандидоз; оцениваются количество, инвазия и клинические проявления |
| Энтеропатогенные бактерии | Salmonella, Shigella | Не относятся к нормальной микробиоте | Выявление требует оценки как потенциального возбудителя кишечной инфекции |
| Респираторные патогены | Bordetella spp. | Не являются типичными обитателями кишечника | Имеют преимущественный тропизм к эпителию дыхательных путей |
Состав кишечной микробиоты оценивают с учетом анатомического биотопа, количественного содержания и патогенного потенциала выявленного микроорганизма. Обнаружение бактерии в образце не всегда означает заболевание, поскольку клиническая значимость зависит от ее штаммовых свойств и состояния пациента. Для различения комменсальных и патогенных эшерихий применяют серотипирование, молекулярное выявление генов токсинов и других факторов вирулентности. Поэтому интерпретация микробиологического исследования должна сочетать лабораторные данные с клинической картиной.