2) общие эпитопы
3) групп-специфические аллельные варианты генов (+)
4) отдельные часто встречаемые группы аллелей генов половых хромосом
Низкоразрешающее типирование HLA определяет не конкретную последовательность каждого аллеля, а принадлежность к аллельной группе, объединённой общими антигенными и генетическими признаками. В номенклатуре HLA такой результат обычно обозначается первым полем: например, HLA-A*02 или HLA-B*07. Он не позволяет достоверно различить отдельные аллели внутри группы, такие как HLA-A*02:01 и HLA-A*02:06.
Для исследования применяют серологические реакции либо молекулярные методы с набором специфичных праймеров или зондов, включая PCR-SSP и PCR-SSO. Эти методы выявляют наличие маркеров, характерных для определённой группы аллелей, но не анализируют весь набор нуклеотидных замен, необходимый для аллель-специфической идентификации. Поэтому правильным является определение групп-специфических аллельных вариантов генов HLA, что имеет значение при первичном подборе донора, оценке совместимости и установлении HLA-фенотипа.
| Уровень типирования | Основной принцип | Тип результата | Практическое значение |
|---|---|---|---|
| Серологическое | Реакция антигенов HLA на панели специфических антител | Антигенная специфичность, например HLA-A2 | Исторически применялось для подбора доноров и оценки совместимости |
| Низкоразрешающее молекулярное | Выявление маркерных последовательностей с помощью PCR-SSP, PCR-SSO или аналогичных тест-систем | Аллельная группа, например HLA-A*02 или HLA-B*07 | Определение групп-специфических вариантов генов при первичном HLA-типировании |
| Промежуточное | Анализ расширенного набора полиморфных участков гена | Сужение перечня возможных аллелей, но не всегда окончательная идентификация | Используется, когда низкоразрешающего результата недостаточно для выбора пары донор–реципиент |
| Высокоразрешающее | Определение дополнительных нуклеотидных различий, кодирующих полиморфные участки HLA | Конкретный аллель, например HLA-A*02:01 | Необходимо для точного подбора донора при трансплантации гемопоэтических стволовых клеток |
| Секвенирование нового поколения | Параллельное чтение значительной части или всей последовательности HLA-гена | Подробный аллельный профиль, включая редкие варианты и фазу полиморфизмов | Повышает точность разрешения сложных и неоднозначных генотипов |
| Аллель-специфическое подтверждение | Прицельное выявление конкретной последовательности или варианта | Подтверждённый отдельный аллель | Применяется для разрешения неоднозначностей и уточнения клинически значимых различий |
Гены HLA расположены в главном комплексе гистосовместимости на коротком плече 6-й хромосомы и не относятся к генам половых хромосом. Низкое разрешение ограничивает объём генетической информации, но обеспечивает быстрый и стандартизованный результат в пределах аллельной группы. Для трансплантационной совместимости, фармакогенетических ассоциаций и исследований редких вариантов часто требуется высокоразрешающее типирование с определением конкретного аллеля.