2) 550
3) 300
4) 700 (+)
Правильный ответ — 700 бэндов на гаплоидный набор хромосом. Такой уровень соответствует высокоразрешающему GTG-бэндингу, при котором исследуют удлинённые прометафазные или раннеметафазные хромосомы. Чем меньше степень конденсации хромосом, тем больше чередующихся светлых и тёмных полос удаётся различить и тем точнее можно локализовать небольшую делецию, дупликацию или точку разрыва. Уровень более 650–700 бэндов позволяет выявлять часть перестроек размером примерно 3–5 Мб, которые могут быть незаметны при стандартном кариотипировании с разрешением 400–550 бэндов.
Синдромы микроструктурных хромосомных перестроек чаще обусловлены потерей или увеличением числа копий небольшого участка хромосомы, содержащего несколько функционально значимых генов. Клинический фенотип формируется вследствие гаплонедостаточности при делеции либо дозового эффекта генов при дупликации. Поскольку размер дефекта нередко приближается к пределу оптического разрешения световой микроскопии, стандартные уровни 300–550 бэндов не обеспечивают достаточной чувствительности; поэтому при отсутствии возможности выполнить локус-специфическую FISH требуется не менее 700 бэндов.
Следует учитывать, что даже высокоразрешающий GTG-анализ не исключает субмикроскопическую перестройку при нормальном кариотипе. FISH выявляет изменение только в заранее выбранном локусе, тогда как хромосомный микроматричный анализ позволяет исследовать число копий участков ДНК по всему геному и в современной диагностике обычно предпочтителен при задержке развития, интеллектуальных нарушениях, множественных врождённых аномалиях и дисморфических признаках.
| Метод или уровень разрешения | Диагностические возможности | Основные ограничения |
|---|---|---|
| GTG, 300 бэндов | Выявление анеуплоидий и крупных структурных перестроек | Недостаточен для поиска небольших делеций и дупликаций |
| GTG, 400 бэндов | Рутинная оценка числа и общей структуры хромосом | Мелкие изменения хромосомного материала часто не визуализируются |
| GTG, 550 бэндов | Стандартное конституциональное кариотипирование с более точным определением точек разрыва | Чувствительность недостаточна для большинства субмикроскопических CNV |
| GTG, 700 бэндов | Высокоразрешающий анализ; возможное выявление перестроек порядка 3–5 Мб | Отрицательный результат не исключает более мелкую делецию или дупликацию |
| GTG, 850 бэндов | Максимально детальная визуальная дифференциация суббэндов | Технически сложен, зависит от качества прометафазных препаратов |
| FISH | Высокочувствительное подтверждение конкретной микроделеции, микродупликации или перестройки | Необходим заранее выбранный зонд; другие участки генома не исследуются |
| Хромосомный микроматричный анализ | Полногеномное выявление делеций и дупликаций значительно меньшего размера | Обычно не определяет сбалансированные транслокации и инверсии |
Уровень бэндинга указывает на суммарное число различимых полос в гаплоидном наборе, а не на число полос одной хромосомы. Качество исследования определяется не только формально достигнутым разрешением, но и количеством пригодных метафаз, равномерностью окрашивания и возможностью сопоставления гомологичных хромосом. При обнаружении подозрительного участка результат желательно подтвердить молекулярно-цитогенетическим или молекулярным методом. Нормальный высокоразрешающий кариотип не является основанием для исключения микроделеционного или микродупликационного синдрома при характерном фенотипе.