2) гликопротеины, встроенные в липидную оболочку вириона
3) последовательности, необходимые для энкапсидации генома
4) белки, необходимые для встраивания генома вируса в геном клетки (+)
Правильный ответ — белки, необходимые для встраивания генома вируса в геном клетки. Область pol ретровирусов кодирует полипротеин, из которого после протеолитического расщепления образуются вирусные ферменты: обратная транскриптаза, интеграза и протеаза. Интеграза обеспечивает интеграцию двуцепочечной ДНК-копии вирусного генома, сформированной обратной транскриптазой, в хромосомную ДНК клетки-хозяина с образованием провируса.
Механизм интеграции включает обработку 3′-концов вирусной ДНК интегразой, формирование комплекса с вирусной и клеточной ДНК и перенос 3′-концов вирусной цепи в геном хозяина. Последующее восстановление разрывов клеточными ферментами приводит к стабильному включению провируса в хромосому. Экспрессия pol обычно связана с трансляцией слитого белка Gag-Pol вследствие программируемого сдвига рамки считывания; вирусная протеаза затем расщепляет его на функциональные ферменты.
Другие варианты соответствуют преимущественно иным участкам генома. Cis-действующие элементы, включая длинные концевые повторы и сигнал упаковки ψ, являются некодирующими регуляторными последовательностями; структурные белки капсида кодируются областью gag, а гликопротеины оболочки — областью env. Поэтому именно pol связывают с ферментативным обеспечением обратной транскрипции, созревания вириона и интеграции вирусной ДНК.
| Участок генома | Основные продукты | Функция | Пример диагностически или терапевтически значимого признака |
|---|---|---|---|
| gag | Матриксный, капсидный и нуклеокапсидный белки | Формирование сердцевины вириона и упаковка вирусного РНК-комплекса | Антиген p24 при ВИЧ-инфекции |
| pol | Обратная транскриптаза | Синтез ДНК на матрице вирусной РНК | Мишень нуклеозидных и ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы |
| pol | Интеграза | Встраивание вирусной ДНК в геном клетки с образованием провируса | Мишень ингибиторов интегразы: долутегравира, биктегравира, ралтегравира |
| pol | Протеаза | Расщепление Gag и Gag-Pol на зрелые функциональные белки | Ингибирование протеазы приводит к образованию незрелых, дефектных вирионов |
| env | Оболочечные гликопротеины | Связывание с рецепторами клетки и слияние вирусной оболочки с мембраной | У ВИЧ: gp120 и gp41; определяют тропизм и проникновение |
| LTR и другие cis-элементы | Некодирующие регуляторные последовательности | Регуляция транскрипции, интеграции, обратной транскрипции и упаковки генома | Сигнал ψ необходим для селективного включения вирусной РНК в вирион |
Интеграция делает генетический материал ретровируса долговременной частью клетки и обеспечивает возможность латентной персистенции. Ошибки обратной транскрипции и интеграции способствуют высокой генетической вариабельности ретровирусов. Функциональная активность вирусной протеазы необходима для созревания инфекционных частиц, поэтому ингибиторы разных продуктов pol используются в комбинированной антиретровирусной терапии. Длительная персистенция провируса также объясняет необходимость терапии, подавляющей репликацию, без возможности элиминации вирусного генома из всех инфицированных клеток.